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一种全基因组多态性SSR分子标记的筛选方法
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专利号
2020103979160
专利类型
发明
申请日
2020-05-12 00:00:00
公开日
2020-08-14 00:00:00
法律状态
有效
国家/地区
中国
IPC分类号
G16B30/00
技术领域
G-物理
申请人/权利人
西藏自治区农牧科学院水产科学研究所
摘要
本发明涉及一种全基因组多态性SSR分子标记的筛选方法，包括：1)基于物种基因组挖掘潜在SSR标记；2)基于待选样本二代测序数据计算每个潜在SSR标记指标；3)随机挑取若干个潜在SSR标记并分别针对每个SSR标记设计引物；分别以每一对引物对待测样本DNA模板进行PCR扩增，获得SSR标记片段及其多态性信息；4)以步骤2)获得的SSR标记指标为特征，以步骤3)获得的多态性信息为分类结果，使用支持向量机